Происходит от существительного зерно, далее от праслав.*zьrno, от кот. в числе прочего произошли: др.-русск. зьрно, ст.-слав. зрьно (κόκκος; Супр.), русск. зерно, зернь ж. «хлеб в зерне», укр. зе́рно, болг. зъ́рно, сербохорв. зр̏но, словенск. zŕno, чешск., словацк. zrno, польск. ziarno, в.-луж. zorno, н.-луж. zerno; восходит к праиндоевр.*gre-no-/*g'er[a]n-/*grān-. Родственно лит. žìrnis «горошина», латышск. zirns, др.-прусск. syrne «зерно», готск. kaúrn, нов.-в.-нем. Korn, лат.grānum «зерно, ядро», др.-ирл. grán «зернышко», первонач. «растёртое», ср. др.-инд. jīrṇás «трухлявый, растёртый, сморщенный, старый». С др. ступенью чередования: др.-в.-нем. kerno «ядро, косточка», др.-исл. kjarni — то же. Ввиду фонетического и акцентологического соответствия отграничение др.-инд. слова от перечисленных выше неоправданно. праслав форма восходит к праиндоевр. *ger- «истираться». Использованы данные словаря М. Фасмера. См. Список литературы.
